Cell: стало известно местоположение 80% белков в живых клетках
Американские ученые из Стэнфордского университета и научной организации CZ
Biohub в Сан-Франциско составили максимально полную карту расположение белков в клетках организма. Исследование опубликовано в научном журнале Cell.
Новый метод под названием «органелльный профайлинг» фиксировал пространственную организацию белковых частиц с недоступным ранее уровнем детализации. Специалистам удалось картировать около 8000 из 10000 видов белков, составляющих клеточную структуру.
Органелльный профайлинг обнаруживает белки в органеллах (постоянных компонентах клетки), а также в жидком внутреннем пространстве и других элементах.
В ходе исследования ученые прикрепили индивидуальные молекулярные метки к 19 клеточным отсекам. Затем они использовали специальные антитела для распознавания клеточных маркеров, чтобы определить белковый состав каждого элемента с помощью масс-спектрометрии.
Эксперимент показал, что клеточные белки способны перемещаться при инфекции. Например, вызывающий простуду коронавирус OC43 менять местоположение 633 видов белков. Эти изменения указали на потенциальный метод борьбы с вирурсом за счет ослабления ферроптоза — механизма программируемого уничтожения клетки.
Исследователи продолжат искать другие примеры характерной перетасовке белков как при вирусных инфекциях, так и при болезни Альцгеймера.
